地球之友和其他国际生物技术的反对组织就ISAAA的结论进行了抨击。地球之友在一报告中宣称，转基因作物不但没有增加作物产量和促进世界贫穷和饥饿问题的解决，反而增加了大量化学品的使用。
ISAAA说，2007年，23个国家种植了1.143亿公顷的玉米、大豆和其他作物，相对2006年上升了12%。此外，29个国家还批准了转基因作物的进口。其中，约9%的生物技术农作物被用来生产生物燃料，这主要是在美国。
虽然中国、印度和加拿大是转基因作物的"主要种植者"，但是美国、阿根廷和巴西在世界种植转基因作物中处于领先地位。
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